信息来源： 人大数学时间 发布时间：2025年11月25日

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2025年11月25日15：30，在中国人民大学公共教学一楼301教室，第三十五期“人大数学时间”活动成功举行。本期活动聚焦蛋白质结构预测与冷冻电镜建模等前沿问题，特别邀请了山东大学杨建益教授，以《基于冷冻电镜的蛋白复合物结构建模算法CryoAtom》为主题，开展报告及前沿问题研讨，吸引了线上线下众多生物信息学爱好者与专业人士参与。活动由龚新奇教授主持，现场学术氛围浓厚。

杨建益教授：基于冷冻电镜的蛋白复合物结构建模算法CryoAtom

杨建益教授深耕蛋白质结构预测与冷冻电镜建模这一生物信息学与结构生物学的交叉前沿学科，围绕三大核心方向系统阐释其方法体系与应用价值。在方法创新层面，他深入剖析AlphaFold2在复合物结构预测中的局限，揭示实验与计算结合的必然趋势；开发局部注意力机制突破全局注意力计算瓶颈，显著降低算法复杂度；将三维旋转位置编码融入Transformer架构，有效捕捉空间几何关系。在技术应用上，其CryoAtom方法通过整合冷冻电镜密度图与结构预测信息，实现了从中等分辨率密度图自动构建全原子结构；通过优化局部结构与全局构象的协同建模，为超大分子复合物、RNA及蛋白-核酸复合物的结构解析提供了高效工具。杨建益教授的研究为冷冻电镜数据的自动化解析注入强劲动力，也为相关方法学研究与实验实践提供了重要参考。

报告结束后，与会学者就蛋白质结构预测、冷冻电镜建模、算法创新等领域展开了深入研讨。

问题的提出

此外，杨建益教授还提出了三个前沿问题：核酸结构的精准预测、生物大分子的动态构象变化和蛋白-核酸-小分子复合物的全原子建模，期待能引起广泛关注，并推动相关领域往纵深发展。

本期“人大数学时间”活动的成功举办，为数学爱好者和专业人士提供了一个宝贵的交流与学习平台，进一步推动了数学前沿问题的研究与发展。