中国人民大学健康大数据研究院推出“数据资源”板块,致力于汇集和整合各类公开数据库,为科学研究提供坚实的数据支撑。目前,我们已经成功收集整理了包括调查数据、医学信息数据、基因组数据、医学影像数据以及临床实验数据等在内的63个数据库,覆盖广泛的健康数据领域,并持续致力于资源的扩展。本栏目的建立旨在为医学研究者和健康专业人士打造一个高效的、一站式数据服务平台,便于大家获取、共享及分析关键的健康信息。本平台不仅开启了科研人员探索未知的可能,同时也为临床决策提供了坚实的数据基础,期望通过公益服务加速医学研究和创新的步伐,深化对人类健康的理解,推动医疗服务的进步。本期将推出基因组数据库系列第四期:开放全基因组关联研究(Integrative Epidemiology Unit (IEU) open GWAS project)数据库的介绍。
(1)Research IT 开发OpenGWAS数据库网站,该网站提供对 VCF文件的访问以及通过OpenGWAS API提供的 GWAS 元数据摘要。研究 IT 还为 IEU 集团的各种服务器、虚拟机、Kubernetes 集群和应用程序提供系统管理员支持,包括 Puppet 配置管理,以提供稳定性和更好的灾难恢复配置。
(2)引用该数据库的权威文献:Said, S., Pazoki, R., Karhunen, V. et al. Genetic analysis of over half a million people characterises C-reactive protein loci. Nat Commun 13, 2198 (2022). https://doi.org/10.1038/s41467-022-29650-5